生信学习笔记:生物信息学测序分析基本流程入门笔记_生信分析基本流程-CSDN博客

网站介绍:文章浏览阅读1w次,点赞7次,收藏137次。文章目录前言短序列比对软件sam文件insertsize基因差异表达计算变异检测物种组成与丰富度计算kmer估计基因组大小序列拼接Pregraph常用序列拼接软件基因组污染分析RNA-seq与meta序列拼接基因功能注释非编码RNA小RNA共线性分析在线序列分析序列比对数据下载前言根据B站教程生物信息快速入门边自学边随手记的笔记,省略了开头几节测序原理以及数据质控,在之前的文章中有粗略提过该部分。目前我自己理解的大致流程基本就是测序——质控——比对拼接(contig、scaffol、mappingd_生信分析基本流程